Sidse Werner studerede på Kunstakademiets Arkitektskole i København på Afdelingen for Industrielt Design. I nogle år arbejdede hun som assistent på Nanna Ditzels tegnestue.
I 1969 modtog hun et arbejdslegat fra Nationalbankens Jubilæumsfond til at studere plastikproduktion i USA. Fra 1970 havde hun sin egen tegnestue. Sidse Werners værker har været udstillet i London, Paris, New York, San Francisco, Köln, Frankfurt, Hannover, Tokyo, Stockholm og Milano.
